Crónica sobre Gepamol

Protein synthesis: an epic on the cellular level

TRADUCCION

TRADUCCIÓN

Archivos para descargar en:

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TRANSCRIPCION Y TRADUCCION

TALLER
Leer los contenidos y ampliar con el video y presentación acerca de transcripción y traducción.

LECCION
http://www.iqb.es/cbasicas/fisio/cap04/cap4_2.htm
http://www.efn.uncor.edu/dep/biologia/intrbiol/adntema2.htm

VIDEO Y PRESENTACION
http://bioclass.over-blog.es/article-30805423.html
http://www.slideshare.net/daniel02/replicacin-y-sntesis-de-protenas

CICLO CELULAR

Presentación del tema ciclo celular disponible en:

http://cid-0da96495a83c09f7.skydrive.live.com/self.aspx/.Public/ciclo%20celular.pdf

CICLO CELULAR

TALLER

Este ejercicio está diseñado para presentarle a usted los eventos que ocurren durante el ciclo celular y el proceso de mitosis que divide el material genético duplicado, creando dos células hijas idénticas. Avance dando click en Página siguiente o Página anterior si quiere repasar el contenido previo.

1. Ingrese al siguiente vinculo:

http://www.biologia.arizona.edu/cell/tutor/mitosis/mitosis.html

2. Desarrolle los contenidos de la página
Lo básico sobre ADN
El Ciclo Celular
Mitosis

3. En el tema de mitosis se puede ver una animación que requiere del programa Quicktime
Animación de Mitosis (480 k)

4. Ingrese al último vinculo y resuelva:
Pruébese usted mismo (11 problemas)

5. Alternativamente en el siguiente vinculo tiene otra opción de poner a prueba sus conocimientos sobre el tema (Ciclo celular y mitosis):
http://www.educa.madrid.org/web/cc.nsdelasabiduria.madrid/Ejercicios/Tema4_1b/ciclo2.htm

6. Use estos problemas para examinar su comprensión del ciclo celular y la mitosis.
Estudie las respuestas es posible que le sirvan para el Parcial II.

7. "Se alcanza el éxito convirtiendo cada paso en una meta y cada meta en un paso". C.C. Cortéz

ARTICULO

TELOMEROS Y REPARACION DE DAÑO GENOMICO
SU IMPLICANCIA EN PATOLOGIA HUMANA

MARIA DEL ROSARIO PEREZ1, DIANA DUBNER1, SEVERINO MICHELIN1, PABLO GISONE1, EDGARDO CAROSELLA2

1Autoridad Regulatoria Nuclear, Gerencia de Apoyo Científico, Laboratorio de Radiopatología, Buenos Aires; 2CEA, Service de
Recherches en Hémato-Immunologie, DSV/DRM, Hôpital Saint-Louis, Institut d´Hématologie

MEDICINA (Buenos Aires) 2002; 62: 593-603

http://docs.google.com/gview?a=v&q=cache:GPBtcYp2XTkJ:www.medicinabuenosaires.com/revistas/vol62-02/6/med6-26.pdf+TELOMEROS+Y+REPARACION+DE+DA%C3%91O+GENOMICO&hl=es&gl=co&sig=AFQjCNEcFCeMjtJYB8r5KHKXQjYvyF4MVQ

INHIBICIÓN ENZIMATICA

http://cid-0da96495a83c09f7.skydrive.live.com/self.aspx/.Public/INHIBITION.zip

ENZIMAS

http://cid-0da96495a83c09f7.skydrive.live.com/self.aspx/.Public/enzimas.ppt

REPLICACIÓN

VIDEO:
http://cid-0da96495a83c09f7.skydrive.live.com/self.aspx/.Public/REPLICATION.avi

PRESENTACIÓN:
http://cid-0da96495a83c09f7.skydrive.live.com/self.aspx/.Public/REPLICATION.avi

EMPAQUETAMIENTO DEL ADN

videos

http://cid-0da96495a83c09f7.skydrive.live.com/self.aspx/.Public/DNA%20packing.avi

El proceso completo incluyendo replicación, transcripción y traducción en

1.http://www.youtube.com/watch?v=Btu9xi48Q_g

Presentación de clase:

http://cid-0da96495a83c09f7.skydrive.live.com/self.aspx/.Public/nucleus.ppt

http://cid-0da96495a83c09f7.skydrive.live.com/self.aspx/.Public/DNA%5EJ%20Genes%5EJ%20Chromosomes%20F08.ppt

PRACTICA DE LABORATORIO

Disgregación de células, conteo en una suspensión y prueba de la viabilidad celular

La tripsinización es una técnica permite separar las células de su soporte mediante un enzima, la tripsina, que rompe las uniones de las células al soporte de un cultivo, así como las uniones entre las células de un tejido. Este proceso debe realizarse con cuidado ya que la tripsina también es capaz de destruir las células por digestión total. Cuando las células se hayan separado deben añadirse a una placa con medio o suero. En el suero hay moléculas que inhiben a la tripsina, parando la reacción impidiendo así la destrucción de las células.
El azul Tripán es una molécula coloreada de gran peso molecular que sólo es capaz de entrar en las células que tienen la membrana alterada. Por tanto una célula viva en perfecto estado se observará incolora mientras que una célula muerta o muy alterada se observará azul. De este modo se puede determinar la viabilidad celular, es decir, el número de células vivas dependiendo del número de células azules que vean en la cámara de Neubauer.
Materiales

- Medio RPMI
- Suero fetal bovino
- Tripsina
- Sangre
- 1 Cámara de Neubauer
- 1 Microscopio óptico de campo claro (objetivo X10)
- Suspensión de células con leucocitos
- Pipetas automáticas
- Pipetas pasteur
- Cubreobjetos para Cámara de Neubauer
- Solución de Azul de Tripán 0,25% (AT)
- Centrifuga
- Baño maría
- PBS
- Placas de microcultivo
- Puntas estériles
- Tubos ependorf de 1.5ml

MATERIALES NECESARIOS TRAIDOS POR GRUPOS:

1. Guantes estériles
2. Candela.
3. Toallas de cocina.
4. Marcador permanente punta fina.
5. Tapa bocas

Trabajar con todo el material estéril
Procedimiento Tripsinizacion
1. Preparar 1 ml de medio de cultivo celular RPMI suplementedo con suero fetal bovino al 10% y precalentarlo a 37ºC en baño maría
2. Precalentar la tripsina a 37ºC
3. Tomar 10 ml de sangre venosa en tubo seco y centrifugar a 2500rpm
4. Separar los leucocitos con pipeta pasteur o micropipeta
5. Colocar las células en las placas de cultivo (Figura 1) con 0.1 ml de medio de cultivo

Figura 1. Placas de microcultivo celular
6. Lavar las placas con 1 ml de PBS (tampón de fosfato y cloruro de sodio a pH 7.4)
7. Aspirar el PBS de las células con una pipeta Pasteur estéril
8. Añadir 0,1 ml de la solución de tripsina/EDTA estéril.
9. Seguir con el microscopio el proceso para comprobar la liberación de las células.
10. Dejar 5 minutos las placas en la incubadora.
11. Continuar mirando el proceso a través del microscopio.
12. Añadir 1 ml del medio RPMI + 10 % FBS (suero fetal bovino).
13. Dejar las placas en la incubadora.

Procedimiento medida de la viabilidad celular y conteo
1. Tomar 10 µl de la solución de células y añadir 90 µl de PBS.
2. Agitar las células con cuidado para asegurarse de la correcta disgregación.
3. Añadir una gota de la solución diluida de células a la cámara de Neubauer
4. Contar el número de células tal como se cuentan leucocitos
5. En un tubo de 1,5 ml poner 800 µl de PBS, 100 µl de la solución de azul tripan y 100 µl de la suspensión de células.
6. Agitar por inversión con cuidado y esperar un minuto.
7. Con la ayuda de la cámara de Neubauer calcular el porcentaje de la viabilidad celular.(Células blancas / células totales) x 100 = % viabilidad
Figura 2. Las células vivas se observan traslucidas

CELLS REVIEW

http://foxbiology.com/ib/cells/index.html

ESTRUCTURA DEL ADN

http://cid-0da96495a83c09f7.skydrive.live.com/self.aspx/.Public/Sem%201%20watsoncrick.pdf

MICROSCOPIA: DIFERENCIAS

http://www.criba.edu.ar/cribabb/servicios/secegrin/microscopia/apunte_col.htm

TALLER

UNIVERSIDAD DEL QUINDIO
FACULTAD DE CIENCIAS BÁSICAS
PROGRAMA DE BIOLOGÍA

Adaptado por Nelson Enrique Arenas Suárez

TALLER # 1
PROTEÍNAS Y ENZIMAS

Las enzimas son catalizadores biológicos de los organismos vivos que se caracterizan por su eficiencia catalítica; así como por su especificidad en su sustrato y reacción en la que participa. Con la excepción de ciertas moléculas catalíticas de ARN, las enzimas son proteínas, o en algunos casos proteínas más compuestos o iones auxiliares que reciben el nombre de cofactores.


Cuál es la composición de las proteínas? Y el contenido de Nitrógeno?
Dibuje la estructura de un aminoácido e identifique los 2 grupos funcionales constituyentes, el carbono, el hidrogeno y el grupo R o cadena lateral.
Por qué se llaman aminoácidos?
Realice una tabla donde clasifique los aminoácidos según su R. Diferencie los aminoácidos básicos, ácidos y aromáticos.
Qué es un isómero? Y qué es un carbono asimétrico o quiral?
Qué diferencia fundamental existe entre la forma no disociada y la forma bipolar de un aminoácido?
Qué importancia específica tienen los L-aminoácidos?
Qué es una enzima?
Que es un complejo enzima-sustrato y qué importancia tiene?
Qué es un centro activo? Defina algunas de sus características?
A que se denomina reconocimiento por adaptación inducida?
Defina los siguientes términos: holoenzima, apoenzima y coenzima.
Cuántas clases de enzimas hay; como se caracterizan?
Defina la inhibición enzimática irreversible.
Que es un inhibidor competitivo.
Explique, brevemente, la distinción entre las inhibiciones competitiva y no competitiva.
Qué es un enzíma alostérico?
Qué es un zimógeno?

TEORIA CELULAR

BRIEF HISTORY
1665- Robert Hooke employed “CELL” concept for the first time.
1824- René Dutrochet extended cellular concept to structural unit.
1838 Mathias Schleiden (plants) and Theodor Schwann (animals) proposed that all living things are made of cells.
1858, Rudolf Virchow established that all cells come from others cells (axioma "ommni cellula e cellula").

CELLULAR THEORY
§ The cell is the smallest structural and functional unit capable of carrying out life processes.
§ Cells are the living building blocks of all plant and animal organisms.
§ The functional activities of each cell depend on the specific structural properties of the cell.
§ All organism’s structure and function ultimately depend on the capabilities of its cells.
§ All new cells and new life arise only from pre-existing cells.
§ Because of this continuity of life, the cells of all organisms are fundamentally similar in structure and function.

Characteristics of All Cells
• A surrounding membrane
• Cytoplasm – cell contents in thick fluid
• Control center with DNA

PROKARYOTIC CELLS
Eukaryotic Cells
First cell type on earth
Kingdoms: Eubacteria and Archaeabacteria
No membrane bound nucleus
Nucleoid = region of DNA concentration
Organelles not bound by membranes
VERY small
Nucleus bound by membrane
Kingdom: fungi, protists, plant, and animal cells
Possess many organelles (structures Bound by
membranes)

EUKARYOTIC CELLS
Mitochondrion: An important cell organelle involved in respiration.
Cytoplasm: A fluid surrounding the contents of a cell and forms a vacuole.
Golgi Apparatus: The processing area for the creation of a glycoprotein.
Endoplasmic Reticulum: An important organelle heavily involved in protein synthesis.
Vesicles: Packages of substances that are to be used in the cell or secreted by it.
Nucleus: The "brain" of a cell containing genetic information that determines every natural process within an organism.
Cell Membrane: Also known as a plasma membrane, this outer layer of a cell assists in the movement of molecules in and out the cell plays both a structural and protective role.
Lysosomes: Membranous sacs that contain digestive enzymes.
Cell Wall: A structure that characteristically is found in plants and prokaryotes and not animals that plays a structural and protective role.

In and Out - getting things into and out of cells

Active Transport - Active transport is the transport of molecules with the active assistance of a carrier that can transport the material against a natural concentration gradient.
Passive Transport (Diffusion) - The movement of molecules from areas of high concentration (i.e. outside a cell) to areas of low concentration (i.e. within a cell) via a carrier. This process does not require energy.
Simple Diffusion - The movement of molecules from areas of high concentration to areas of low concentration in a free state. Osmosis of water involves this type of diffusion through a selectively permeable membrane (i.e. plasma membrane).

The Breakdown of Materials in a Cell

In cells, sometimes it is required to breakdown more complex molecules into more simple molecules, which can then be 're-built' into what is needed by the body with these new raw materials.

'Pinocytosis' where to contents of a structure (such as bacteria) are drank, essentially by breaking down molecules into a drinkable form.

'Phagocytosis' where contents are 'eaten'. See cell defence for more information in regards to this.

Absorption and Secretion
Absorption is the uptake of materials from a cells' external environment. Secretion is the ejection of material.

MICROSCOPY

Cells are too small to see by the naked eye
Antony van Leeuwenhoek (1632-1723) - developed some of the earliest microscopes
Modern Microscopes
Bright Field, Fluorescence, Phase Contrast, Dark Field, Differential Interference, Digital Video Microscopy, Confocal, 2 photon confocal, spinning disc confocal, total internal reflection fluorescence (TIRF),
Electron Microscope (EM)
Transmission, scanning, scanning tunneling
Magnetic Resonance Imaging (MRI)

Modern Cell Biology

Arose from 3 separate fields becoming interwoven over the last 50 years
Cytology
Biochemistry
Genetics

Cytology
Oldest branch
Dependent on optical techniques
1870 invention of microtome for sectioning biological specimens
Light Microscope
Biochemistry
1828 Freidrich Wohler showed urea synthesis from ammonium and cyanate (organic compounds synthesized from inorganic compounds)
biological chemistry (biochemistry) the same as all other chemistry
1868 Louis Pasteur shows yeast cells needed for fermentation of sugar into alcohol (living organisms for specific chemical processes)
1897 Hans Buchner shows that extract from yeast cells also works (enzymes)
1920’s-30’s Biochemical pathways (glycolysis, Krebs cycle (TCA), ATP for energy)
Genetics
1866 Gregor Mendel hereditary factors (genes) and segregation (took 35 years before work recognised)
1876 Walther Flemming identified chromosomes
1900 Walter Sutton chromosome theory of inheritence
1944 Avery et al. genetic transformation in Bacteria)
1953 James Watson and Francis Crick double helix model

TECNICAS DE BIOLOGIA CELULAR

http://homepages.gac.edu/~cellab/index-1.html

GALERIA DE IMAGENES MICROSCOPIA

http://www.ou.edu/research/electron/www-vl/image.shtml

ENLACES DE INTERES

http://legacy.lclark.edu/~reiness/cellbio/lectures/lectures.htm
http://cellbiologypowerpoints.googlepages.com/home
http://temas-biologiacym.blogspot.com/
http://www.isftic.educacion.es/w3/eos/MaterialesEducativos/mem2001/biologia/index.html
http://biologica.concord.org/index.html
http://webcast.berkeley.edu/course_details_new.php?seriesid=2009-B-58324&semesterid=2009-B